一、流动池内有气泡：
如果有气泡连续不断地通过流动池，将使噪音增大。如果气泡较大，会在基线上出现许多线状峰。这是由于系统内有气泡，需要对流动相进行充分的除气，检查整个色谱系统是否漏气，再加大流量驱除系统内的气泡。
二、流动池被污染：
无论参比池或样品池被污染，都可能产生噪音或基线漂移，要注意溶剂的互溶性。如果污染严重，需要依次采用1mol/L硝酸、水和新鲜溶剂冲洗，或取出池体进行清洗，或更换窗口。
三、光源灯出现故障：
紫外或荧光检测器的光源灯使用到极限或者不能正常工作时，可能产生严重噪音，基线漂移，出现平头峰等异常峰，甚至使基线不有回零，这时需要更换光源灯。
四、倒峰：
倒峰的出现可能是检测器的极性接反，改正后即可变成正峰。
用示差折光检测器时，如果组分的折光指数低于流动相的折光指数，会出现倒峰，需要选择合适的流动相。
如果流动相中含有紫外吸收的杂质，使用紫外检测器时，无吸收的组分会产生倒峰，因此，必须用高纯度的溶剂作流动相。
高效液相色谱仪色谱柱性能的评价包括评价内容和评价方法等方面。
一、评价内容：
1、分离效能。
2、对指定溶质的选择性。
3、在不同PH值介质中的稳定性。
4、不同批次但同型号填料间性能的重现性。
5、适宜的操作压力等。
二、评价方法：
以指定的一组标准溶质为样品，测定其在色谱柱上的理论塔板数，作为柱效的衡量指标。
例：对于反相色谱填料，可以选择一组具有不同极性的芳香族化合物，如苯、萘、菲、苯、甲苯和二甲苯等作为基本组分，再加以苯酚和苯胺等酸、碱性溶质。
高效液相色谱仪色谱柱在色谱分析系统中主要起着分离检测物质的作用，如同色谱系统的心脏，同时也是易损耗品。什么情况下会导致液相色谱柱柱效降低甚至“失效”。
1、筛板堵塞
色谱柱入口筛板堵塞是常见的问题之一，会导致柱压升高、色谱峰拖尾、塔板数降低等问题。通常分析样品中微粒杂质最右可能堵塞色谱柱入口，因此分析时，需要先过滤或者离心，乳浊或浑浊样品应以0.25?m滤膜处理，也可用针头过滤器过滤。进样器与泵密封垫的磨损也会带入微粒，在进样阀与色谱柱之间使用0.25?m或0.45?m的在线过滤器，通常可以避免这类问题
2、强保留样品组分
强吸附性的样品组分吸附在柱头填料上，能严重地影响色谱柱寿命。像生物组织或体液的提取物、天然产物等复杂样品，极易造成柱头的污染。相对较纯的样品，一般不会出现这一问题。色谱柱应用中，色谱峰严重拖尾或分裂往往是强保留污染物在柱头吸附的体现。
3、色谱柱装填不良
装填不良的色谱柱，在短时间应用后，填充床的压缩通常使柱头处产生塌陷，导致柱效突然降低。色谱柱的初始评价指标，如塔板数、不对称因子等往往不能很好地表征色谱柱床层的稳定性，这种情绪只能在实际应用中发现。
4、压力因素
液相色谱仪色谱柱使用过程中的骤然压力波动、机械撞击或温度骤然变化都会对色谱柱床层产生影响，导致峰形变差和柱效降低。进样过程中，进样阀转动太慢可引起压力波动，使色谱柱床产生裂隙，在柱切换时也存在同样的问题。使用填充良好的色谱柱，在较低柱压下操作，可大大减少由压力波动造成的色谱柱损坏。
有些色谱柱厂家建议在使用液相色谱柱时加入保护柱，保护柱是收集、阻断来自进样器的机械和化学杂质，以保护和延长分析柱的使用寿命。
柱子的再生
色谱柱属于色谱分析的常用消耗品，它是有寿命的；但它寿命的长短与我们的样品处理程度、有无加保护柱以及清洗是否恰当和彻底紧密相关！当柱子在使用一段时间以后，它的柱压可能升高，柱效可能降低，这时如果我们对柱子进行再生，它的寿命也许会得到一定的延长。
柱子使用
1、首先要确认您所要分析的样品流动相的pH范围是否在您的柱子的pH范围之内，以免损坏柱子硅胶！
2、接下来就是用你做样品的流动相去平衡柱子，如果您的流动相中含有缓冲盐溶液，在平衡柱子之前务必要先用5％的甲醇(乙腈)/水去过渡10倍柱体积(150x4.6mm柱子约为30ml，250x4.6mm柱子约为45ml；下同)以上，再用带盐的流动相去平衡柱子足够的时间(直到基线非常平稳为止)，之后方可进样分析。
3、无论您分析何种样品，都会由于各种原因样品中总有部分杂质，因此建议您在进样前在柱子前端加接保护柱以保护您那昂贵的分析柱，或者用0.2um或 0.45um针头过滤器过滤样品后方进样分析！
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