高效液相色谱仪主要有进样系统、输液系统、分离系统、检测系统和数据处理系统，下面将分别叙述其各自的组成与特点。
1.进样系统一般采用隔膜注射进样器或高压进样间完成进样操作，进样量是恒定的。这对提高分析样品的重复性是有益的。
2.输液系统该系统包括高压泵、流动相贮存器和梯度仪三部分。高压泵的一般压强为l.47～4.4X107Pa，流速可调且稳定，当高压流动相通过层析柱时，可降低样品在柱中的扩散效应，可加快其在柱中的移动速度，这对提高分辨率、回收样品、保持样品的生物活性等都是有利的。流动相贮存错和梯度仪，可使流动相随固定相和样品的性质而改变，包括改变洗脱液的极性、离子强度、PH值，或改用竞争性抑制剂或变性剂等。这就可使各种物质(即使仅有一个基团的差别或是同分异构体)都能获得有效分离。
3.分离系统该系统包括色谱柱、连接管和恒温器等。色谱柱一般长度为10～50cm(需要两根连用时，可在二者之间加一连接管)，内径为2～5mm，由"优质不锈钢或厚壁玻璃管或钛合金等材料制成，住内装有直径为5～10μm粒度的固定相(由基质和固定液构成).固定相中的基质是由机械强度高的树脂或硅胶构成，它们都有惰性(如硅胶表面的硅酸基因基本已除去)、多孔性(孔径可达1000?)和比表面积大的特点，加之其表面经过机械涂渍(与气相色谱中固定相的制备一样)，或者用化学法偶联各种基因(如磷酸基、季胺基、羟甲基、苯基、氨基或各种长度碳链的烷基等)或配体的有机化合物。因此，这类固定相对结构不同的物质有良好的选择性。例如，在多孔性硅胶表面偶联豌豆凝集素(PSA)后，就可以把成纤维细胞中的一种糖蛋白分离出来。
另外，固定相基质粒小，柱床极易达到均匀、致密状态，极易降低涡流扩散效应。基质粒度小，微孔浅，样品在微孔区内传质短。这些对缩小谱带宽度、提高分辨率是有益的。根据柱效理论分析，基质粒度小，塔板理论数N就越大。这也进一步证明基质粒度小，会提高分辨率的道理。再者，高效液相色谱的恒温器可使温度从室温调到60C，通过改善传质速度，缩短分析时间，就可增加层析柱的效率。
高效液相色谱仪可以完成二元高压梯度洗脱，也可以拓展为制备系统，采用高压混合器连接两个高压恒流泵，利用RS232通讯，即可实现梯度分析；
便于用户自由选择与搭配，混合器材主要由不锈钢、生物惰性PEEK等构成，用途广泛；
可广泛应用于研究开发、医药检验、食品检测、化工分析、环境监测等众多分析领域。
高效液相色谱仪分离原理：液-液分配(Liquid-liquid Partition Chromatography)及化学键合相色谱(Chemically Bonded Phase Chromatography) 流动相和固定相都是液体。
流动相与固定相之间应互不相溶（极性不同，避免固定液流失），有一个明显的分界面。
当试样进入色谱柱，溶质在两相间进行分配。达到平衡时，高效液相色谱仪报价，服从于高效液相色谱计算公式；
6种定量计算方法：归一法、修正归一法、带比例因子的修正归一法、内标法、外标法，高效液相色谱仪适用范围，以及指数计算法。
高效液相色谱仪特点：
1、梯度洗脱内部软件可自控制，编辑、存贮60个梯度方法，运行复杂的梯度程序；
2、泵形式：串联双柱塞 浮动式密封圈；泵头自冲洗功能，泵无须手动排空即可输液“自吸式单向阀”技术，可延长密封圈使用寿命；
3、光路系统采用精密定位结构和独特的散热技术，高效的光学系统和数字过滤；
4、程序化的溶剂类和压缩因子，可自动补偿；完整的预清洗功能，更于快速溶剂更换；
5、波长调节功能：既可由键盘面板控制也可由程序软件设定，全封闭集成型光电检测元件，无需任何机械部分调整即可选择或改变波长；
6、光源运行时间在线监测并显示，方便用户确定光源寿命；
7、三条流量校正曲线以及特有的多点参数校正，保障了极高的流量准确性；
8、梯度：高压2-3元；梯度方式：高压，梯度洗脱内部软件可自控制，可通过PC机及泵控制；
9、实时显示样品池和参比池能量，方便判断光源和流通池状态；
10、紫外检测器具有自动波长定位调整，自动调零，多量程输出选择；
11、智能化高，可实现网络化平台监控，提高了你的QC效益；
12、自动化，让你从繁锁的分析操作中解放出更多的时间。
色谱柱是高效液相色谱的心脏，在高效液相色谱仪的使用中，保持色谱柱的柱效、容量和渗透性，延长柱子的使用寿命非常重要。色谱柱压升高一般是由于柱床内产生了杂质，造成流体阻力加大所致。这两个原因，大致又可以分为以下几方面：
1、流动相的前处理
杂质堵塞色谱柱进口滤片，导致压力升高。这是由于流动相可能没有过滤，或过
滤不彻底，使固体杂质滞留于滤板上所致。
2、样品的沉淀
当溶解样品的溶剂与流动相不一致时，样品进入色谱柱时，可能因溶解度降低而沉淀出来，
造成压力升高。
3、晶体的析出
使用含有缓冲液的流动相时，缓冲液中的无机盐可能会残留在体系之中，它们会因在新流动
相中的溶解度降低而析出，造成流体阻力加大、压力升高。
4、细菌或霉菌孳生
霉菌在流动相中、管路中或柱子进口处繁殖、生长堵塞滤板，导致压力升高。所以在使用磷
酸盐缓冲液时一般要现配现用。
5、溶质吸附
当溶质在柱子上有较强的吸附，且所用的流动相难以将它们洗脱时，累积的未洗脱溶质也会
造成阻力增大和压力升高。
6、流动相更换过度较快
当改变流动相体系时，不彻底的更换使不同性质、互不混溶的流动相存在于同一个体系之中，也会造成压力升高。
7、压力脉冲
运行过程中，有时会产生系统内压力的突然升降。如此所形成的压力脉冲会造成多孔填料的
崩坏和柱床结构的微小变化，填料微屑的长期积累也可能会使柱床阻力增大，造成压力升高。
处理对于缓冲液盐分如(乙酸铵等)沉积于柱内的情况先用40～50℃的纯水,低速正向冲洗柱子,待柱压逐渐下降后,相应提高流速冲洗,柱压大幅度下降后,用常温纯水冲洗,之后用纯甲醇冲洗柱子30分钟;
对于样品污染沉积的情况,由样品的沉积引起污染的C18柱,和纯水反向冲洗柱子,然后换成甲醇冲洗,接着用甲醇+异丙醇(4+6)冲洗柱子(冲洗时间的长短由样品污染的情况而定),再用换成甲醇冲洗,然后用纯水冲洗,最后甲醇冲洗正向冲洗柱子30分钟以上。
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