离子色谱主要用于环境样品的分析，包括地面水、饮用水、雨水、生活污水和工业废水、酸沉降物和大气颗粒物等样品中的阴、阳离子，与微电子工业有关的水和试剂中痕量杂质的分析。
和一般的HP LC 仪器一样, 现在的离子色谱仪一般也是先做成一个个单元组件, 然后根据分析要求将各所需单元组件组合起来。基础的组件是流动相容器、高压输液泵、进样器、色谱柱、检测器和数据处理系统。
此外，可根据需要配置流动相在线脱气装置、自动进样系统、流动相抑制系统、柱后反应系统和全自动控制系统等。
离子色谱是高效液相色谱的一种，故又称高效离子色谱（HPIC）或现代离子色谱，其有别于传统离子交换色谱柱色谱的主要是树脂具有很高的交联度和较低的交换容量，进样体积很小，用柱塞泵输送淋洗液通常对淋出液进行在线自动连续电导检测。
离子色谱仪的工作过程是: 输液泵将流动相以稳定的流速( 或压力) 输送至分析体系, 在色谱柱之前通过进样器将样品导入, 流动相将样品带入色谱柱, 在色谱柱中各组分被分离, 并依次随流动相流至检测器, 抑制型离子色谱则在电导检测器之前增加一个抑制系统。
即用另一个高压输液泵将再生液输送到抑制器, 在抑制器中, 流动相的背景电导被降低, 然后将流出物导入电导检测池, 检测到的信号送至数据系统记录、处理或保存。
非抑制型离子色谱仪不用抑制器和输送再生液的高压泵, 因此仪器的结构相对要简单得多, 价格也要便宜很多。
阴阳离子的交换方程可以表示为：
阴离子交换：R+Y-+X-=R+X-+Y-
阳离子交换：R-Y++X+=R-X++Y+
其中：R+，R-为固定相上的离子交换基团；
Y+，Y-为可交换的平衡离子，例如H+，Na+或OH-，Cl-；
X+，X-为组分离子。
离子色谱仪主要测定流程：
测定步骤：
(1)进样：水样待测离子首先与分离柱的离子交换树脂之间直接进行离子交换(即被保留在分离柱上)；
(2)淋洗：如用NaOH作淋洗液分析样品中的F-、Cl-和SO42-等，保留在分离柱上的阴离子即被淋洗液中的OH-基置换并从分离柱上被洗脱。对树脂亲和力弱的待分析离子(如F-)则先于对树脂亲和力强的待分析离子(如SO42-)被依次洗脱；
(3)阻留：淋出液经过抑制柱，将来自淋洗液的背景电导抑制到最小(即去除NaOH)，这样当待测离子离开抑制柱进入电导池时就有较大的可准确测量的电导信号。
(4)测定：根据依次进入电导检测器的待测离子电导率差异，可进行定量测定。
离子色谱仪实验步骤：
1、过滤：用0.45μm过滤膜过滤。
目的是：去除样品中所包含的，有可能损坏仪器或者影响色谱柱/抑制器性能的成分——有机大分子；去除有可能干扰目标离子测定的成分。
2、进样:手动进样。用针管吸取1mL水样推进进样口。
注意：水样不要交叉污染，清洗针管
3、分析水样:自动分析水中的氟离子、氯离子、硝酸根离子、亚硝酸根离子、磷酸根离子、硫酸根离子。
实验中注意事项：
1、查淋洗液与分离柱是否一致:是否过期(30天)，是否满足当天的需要，废液桶的容量；
2、接通气路并调节气压至操作压力：压缩气瓶的输出压力、淋洗液瓶的压力；
3.排除气泡：根据实际情况进行(当更换溶液/闲置)，淋洗液加压后旋松废液阀，开泵冲洗1——2分钟后，停泵，旋紧废液阀。
(1)分离阳离子，用无机酸作淋洗剂(HCl,HNO3)，抑制柱---强碱性高容量阴离子交换柱，ROH-+H+Cl-=RCl-+H2O，ROH-+M+Cl-=RCl-+M+OH-抑制反应降低淋洗液电导率OH-淌度为Cl-的2.6倍，提高灵敏度。
(2)分离阴离子，淋洗剂是NaOH,NaHCO3，抑制柱---强酸性高容量阳离子交换柱，R-H++Na+OH-=R-Na++H2O，R-H++Na+X-=R-Na++H+X-抑制反应降低淋洗液电导率，H+淌度为Na+的7倍，提高灵敏度。
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