高效毛细管电色谱仪（CEC）填充毛细管柱是将固定相填充到毛细管中，通过两端烧结柱塞将固定相保持在毛细管中而成，其最大优点是可利用众多的HPLC固定相，根据化合物与固定相的作用不同实现高效分离，在CEC中应用广泛。
填充毛细管柱制备方法有高压匀浆填充法、电动填充法和超临界CO2法等。
一、高压匀浆填充法：
高压匀浆填充法是填充毛细管柱常用的制备方法。
填充过程一般包括烧结进样端柱塞、高压填充、烧结出口端柱塞、除去不需要的固定相和检测窗口制作等步骤。
高压匀浆填充法简单，快速，但操作技术要求较高。由于在分离样品时施加电场，会使表面带电荷的固定相沿某一方向电泳，容易造成柱局部过于紧密产生较大的压力，而局部由于固定相迁移形成较大的空隙。
二、电动填充法：
电动填充是利用电泳原理，使固定相在一定pH下带电荷，在电场中定向移动而把固定相填充到毛细管中。与高压匀浆填充法相比，电动填充法可有选择地把荷质比相同的固定相填入毛细管中，柱床均匀。
三、超临界CO2法：
超临界CO2法是在毛细管柱一端制作临时柱塞后，另一端与贮液罐相连，将预填充的填料放入贮液罐中，然后利用超临界CO2将填料填入毛细管中，再缓慢释放压力至常压而得到干的色谱柱。柱使用前用流动相润洗，平衡。
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高速逆流色谱法于1982年由美国国立卫生院Ito博士研制开发的一种新型的、连续高效的液液分配色谱技术，与其它色谱技术不同的是它不需任何固态载体，因此能避免固相载体表面与样品发生反应而导致样品的污染、失活、变性和不可逆吸附等不良影响。
同时它也具有适用范围广、快速、进样量大、费用低、回收率高等优点。因此，己在生物、医药、食品、材料、化妆品和环保等领域获得了广泛的应用，尤其是在天然产物活性成分的分离纯化领域倍受重视。
高速逆流色谱仪原理及特点
HSCCC利用了一种特殊的流体动力学（单向流体动力学平衡）现象。具体表现为一根100多米长的螺旋空管，注入互不相溶的两相溶剂中的一相作为固定相，然后作行星运动；同时不断注入另一相（流动相），由于行星运动产生的离心力场使得固定相保留在螺旋管内，流动相则不断穿透固定相；这样两相溶剂在螺旋管中实现高效的接触、混合、分配和传递。由于样品中各组分在两相中的分配比不同，因而能使样品中各组分得到分离。
重现性好。如果样品不具有较强的表面活性作用，酸碱性也不强，那么多次进样，其分离过程稳定性都保持很好、峰的保留相对标准偏差也小于2%，重现性相当好。
应用领域：
（1）天然产物已知有效成分的分离纯化
（2）化学合成物质的分离纯化
（3）中药一类、五类新药的开发
（4）中药指纹图谱和质量控制研究
（5）抗生素的分离纯化
（6）天然产物未知有效成分的分离纯化（新化合物开发）
（7）海洋生物活性成分的分离纯化
（8）放射性同位素分离
（9）多肽和蛋白质等生物大分子分离以及手性分离等
应用范围广，适应性好。由于溶剂系统的组成与配比可以是无限多的，因而从理论上讲HSCCC适用于任何极性范围的样品的分离，所以在分离天然化合物方面具有其独到之处。并因不需固体载体，而消除了气液色谱中由于使用载体而带来的吸附现象，特别适用于分离极性物质和其它具有生物活性的物质。
一、根据相对分子质量选择：
1、相对分子质量很低的样品采用气相色谱。
2、液液分配色谱、液固吸附色谱和离子交换色谱适合分析相对分子质量为 200～2000 的样品。
3、相对分子质量大于 2000 的样品，采用凝胶色谱为优。
二、根据溶解度选择：
1、溶于水并能离解的样品，采用离子交换色谱。
2、溶于烃类（如苯或异辛烷等）的样品，可采用液固吸附色谱。
3、溶于 CCl4 的样品，多采用液液分配色谱和液固吸附色谱。
4、既溶于水又溶于异丙醇的样品，常用水和异丙醇的混合液作液液分配色谱的流动相，以疏水性化合物作固定相。
三、根据分子结构选择：
1、酸、碱化合物采用离子交换色谱。
2、脂肪族和芳香族采用液液分配色谱、液固吸附色谱。
3、异构体采用液固吸附色谱。
4、同系物不同官能团和强氢键化合物采用液液分配色谱。
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