菌落计数器是一种数字显示式半自动细菌检验仪器。由计数器、探笔、计数池等部分组成。计数器采用CMOS集成电路设计制造。黑色纵深背景式记数池内，采用节能环形荧光灯侧射照明，菌落对比清楚。按照细菌计数检验规程规定，仪器显示器设计为三位数，当一只培养皿中菌落生长数超过300个时，应将检验样品稀释重作，以保证计数的准确性。
本仪器可减轻实验人员的劳动强度,提高工效和工作质量。产品广泛用于食品、饮料、药品、生物制品、卫生用品、饮用水、工业废水、临床标本中细菌数的检验。是各级卫生防疫站、环境监测站、食品卫生监督检验所、医院、生物制品所、药检所、食品厂、日化厂及大专院校、科研单位实验室的必备仪器。
使用方法
a.接通电源，拨动开关计数池内灯亮，显示屏显示“001”，将探笔插头插入仪器的插孔内，按下“复位”键调零使仪器进入工作状态。
b.放入待检培养皿。
c.用探笔在培养皿底面对所有的菌落逐个点数。此时，菌落处被标上颜色，蜂鸣器发生鸣叫，表示计数有效。显示屏内数字自动累加。
d.用放大镜仔细检查，确认点数无遗漏，计数即已完毕。（如有遗漏，可用“手动”计数按键补计。）
e.显示屏内的数字即为该培养皿的菌落数。
f.记录数字后取出培养皿。按“复位”键，显示屏进入初始状态。
全自动菌落计数器因其计数准确、自动化程度高、可留存样品信息、使用方便，一般可在数秒内统计出样品菌落数、性价比高等优点，而受到众多企业、医院、科研院所的喜爱，但是由于全自动菌落计数器的科技含量较高，如果选型出现问题，对日后的检验、科研工作会带来很大不便，所以可以的办法就是在挑选时一定要挑选一台满足使用需求的菌落计数器，那如何选购一款优质的菌落计数器呢?
一、根据实际使用需求来确定CCD传感器的档次
很多用户偏向于选择像素高的菌落计数器，却没考虑到检验和科研的实际应用需求，所以用户在选购前就要确定好自己要买多少像素的CCD传感器。
二、看图像采集通道功能，指标越多越好
所谓"图像采集通道"，就是菌落计数器对于样品信息的获取能力，也就是标志着菌落计数器开始计数统计前的初始信息是否真实可靠。如果图像采集通道功能过于单一，那当后期计数时时会很容易出现误判，所以"图像采集通道"指标越多越好。指标响应时间越小，则标志着该菌落计数器获取样品信息的能力越强。
三、看最小菌落分辨率为多少
一般入门级菌落计数器最小菌落分辨率多半有0.1mm左右的效果，中等机型有0.05mm的水准，若实际比较入门、高阶机型的图档显示能力，拥有高分辨率的计数器，在菌落较小时效果会更明显。
四、看有没有数据及报表管理功能
在选购菌落计数器时一定要选有具有数据及报表管理功能的设备，于由微生物的不可复检性，对于以往检验数据的管理和回溯极为重要，不然在实际开展工作时繁杂的统计数据和报表管理会耗尽科研人员的精力。
五、不要指标高的，就要效果好的
现在有些菌落计数器在给用户介绍时，会宣传他们的产品有多少多少功能，多高多高的指标，实际上等真正买回家，根本用不到这么多功能，重要的还是要统计菌落的实际效果好不好，不能为了过多的功能而买一个效果不是很好的设备。而统计效果的好坏关键在于算法是否合理。
六、看使用是否方便
全自动菌落计数器的一个主要优点在于它降低了人工统计菌落的工作量，减轻了工作人员的工作强度，但由于菌落形态和样品状态的不确定性，市面上大多数菌落计数器都较为强调通过人工干预来提高准确度。用户在选购设备时应注意操作是否简便、是否符合工作人员的操作习惯和操作思路。一般来说，需要的人工干预越小，使用越简便。
菌落计数器在皮氏培养皿上计算微生物的数目是一件非常耗时的工作。有了菌落计数器这种仪器，用户就不必为这项复杂的操作费心了，它可广泛应用在每个生物实验室中。
菌落计数器基本操作一般包括：样品的稀释--倾注平皿--培养48小时--计数报告
1．操作方法：培养到时间后，计数每个平板上的菌落数。可用肉眼观察，必要时用放大镜检查，以防遗漏。在记下各平板的菌落总数后，求出同稀释度的各平板平均菌落数，计算处原始样品中每克（或每ml）中的菌落数，进行报告。
2．到达规定培养时间，应立即计数。如果不能立即计数，应将平板放置于0－4℃，但不得超过24h。
3．计数时应选取菌落数在30~300之间的平板（SN标准要求为25~250个菌落），若有二个稀释度均在30~300之间时，按国家标准方法要求应以二者比值决定，比值小于或等于2取平均数，比值大于2则其较小数字（有的规定不考虑其比值大小，均以平均数报告）。
4．若所有稀释度均不在计数区间。如均大于300，则取最高稀释度的平均菌落数乘以稀释倍数报告之。如均小于30，则以最低稀释度的平均菌落数乘稀释倍数报告之。如菌落数有的大于300，有的又小于30，但均不在30~300之间，则应以最接近300或30的平均菌落数乘以稀释倍数报告之。如所有稀释度均无菌落生长，则应按小于1乘以最低稀释倍数报告之。有的规定对上述几种情况计算出的菌落数按估算值报告。
5．不同稀释度的菌落数应与稀释倍数成反比（同一稀释度的二个平板的菌落数应基本接近），即稀释倍数愈高菌落数愈少，稀释倍数愈低菌落数愈多。如出现逆反现象，则应视为检验中的差错（有的食品有时可能出现逆反现象，如酸性饮料等），不应作为检样计数报告的依据。
6．当平板上有链状菌落生长时，如呈链状生长的菌落之间无任何明显界限，则应作为一个菌落计，如存在有几条不同来源的链，则每条链均应按一个菌落计算，不要把链上生长的每一个菌落分开计数。如有片状菌落生长，该平板一般不宜采用，如片状菌落不到平板一半，而另一半又分布均匀，则可以半个平板的菌落数乘2代表全平板的菌落数。
7．当计数平板内的菌落数过多（即所有稀释度均大于300时），但分布很均匀，可取平板的一半或1/4计数。再乘以相应稀释倍数作为该平板的菌落数。
8．菌落数的报告，按国家标准方法规定菌落数在1~100时，按实有数字报告，如大于100时，则报告前面两位有效数字，第三位数按四舍五入计算。固体检样以克（g）为单位报告，液体检样以毫升（ml）为单位报告，表面涂擦则以平方厘米（cm2）报告。
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