在化学、工业行业中高效液相色谱仪被广泛使用，用户在使用中偶尔也会出现一些问题，下面就一些常见液相色谱仪的故障问题为用户进行总结分析。
第一、液相色谱仪中有气体冒出
如果液相色谱仪有气泡流出，不管是通过关闭色谱仪泵或者是打开色谱仪下阀，都没解决气泡产生的问题，有可能是机器的过滤器长期的受到了腐蚀的影响，使霉菌等物质阻塞了液相色谱仪。
故障解决办法：一般情况下用超声波来清洗5-10分钟左右，或者是可以将过滤器浸泡在硝酸钠溶液当中轻微的摇晃，然后用清水进行冲洗就可以了。进行完上述操作后，如果色谱仪还是会有气泡的话，只能证明过滤器内部被腐蚀的非常严重，则要用色谱用甲醇在冲洗半个小时然后超声波清洗半小时后用清水清理干净泄压阀关闭就可以
第二、液相色谱仪出现无指示的故障
色谱仪当出现无指示的故障时，主要原因是泵的垫圈有了的磨损和大量的气体进入到了泵体当中。
故障解决办法：检查是色谱仪垫圈出了问题，更换一个垫圈即可。如果是出现了第二种问题，在液相色谱泵的作用下在泵的出口处将空气尽快的抽出。如果问题还是无法解决这个时候就可以，拆下色谱仪当中的单向阀，进行超声波的清洗过程。
超高效液相色谱仪与普通高效液相色谱原理相同，因此，在使用中应注意的问题是相同的。
要想成为一个合格的色谱分析者，良好的实验规范与习惯是非常必要的。一些小细节的失误或忽视一些简单的问题往往导致实验结果不理想或损坏仪器，从而造成重大的损失。
而在使用中从最初的样品准备开始也有细节部分需要注意：
在保证目标物回收率的情况下，尽量除去样品中其它杂质。
选用合适的滤膜（滤膜有水溶型、脂溶型、通用型、超高效液相色谱用0.2?m）过滤样品，确保样品中不含固体颗粒。可以使用与初始流动相组成相同的溶剂溶解样品，在反相分析时，用比流动相极性更低的有机相；在用正相分析时，如在亲水色谱分析时，溶解样品的一定是高极性有机相，否则，会引起色谱峰的变形，比如保留时间提前、双峰等。
在保证灵敏度与准确度的前提下，进样量要尽量小。
高效液相色谱仪是利用混合物各组分在固定相和流动相中溶解、分配或吸附等化学作用性能的差异，使各组分在作相对运动的两相中反复多次受到上述各作用力而达到相互分离。高效液相色谱仪在食品分析、环境分析、生命科学、医学检验和无机分析等领域得到广泛使用。一般来说，80%～85%的有机物原则上可采用高效液相色谱仪分析。
一、在食品分析中：
1、食品营养成分分析：蛋白质、氨基酸、糖类、色素、维生素、香料、有机酸（邻苯二甲酸、柠檬酸和苹果酸等）、有机胺和矿物质等分析。
2、食品添加剂分析：甜味剂、防腐剂、着色剂（柠檬黄、苋菜红、靛蓝、胭脂红、日落黄和亮蓝等）和抗氧化剂等分析。
3、食品污染物分析：霉菌毒素（黄qu霉毒素、黄杆菌毒素和大肠杆菌毒素等）、微量元素和多环芳烃等分析。
二、在环境分析中：
多环芳烃（特别是稠环芳烃）和农药残留（氨基甲酸脂类，反相色谱）等分析。
三、在生命科学中的应用：
1、低分子量物质：氨基酸、有机酸、有机胺、类固醇、卟啉、糖类和维生素等分析。
2、高分子量物质：多肽、核糖核酸、酶（胰岛素、激素、细胞色素和干扰素等）和蛋白质等分析。
四、在医学检验中：
1、合成药物：抗生素、抗忧郁药物和黄胺类药等分析。
2、天然药物生物碱：吲哚碱、颠茄碱和强心甙等分析。
五、在无机分析中：
阳、阴离子等分析。
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