目镜(eyepiece)的功能只在于放大由物镜所完成的物像。最普通的目镜就是惠更斯目镜。为了弥补物镜在成像过程中所造成的像差，可以使用补偿目镜。补偿目镜的镜筒上刻有英文“C"，俄文“K”字母。这是补偿一词compensation或KoMneHCaQM，的字头。
为了观察者的视觉愉快使视野广阔，各大厂家出售着广视野高接点目镜。这种目镜的视场数值已达25mm，并且带眼镜者不必摘眼镜就可以观察.这种目镜的外壳上刻有眼镜框像。用于显微照像的专用长焦距目镜上刻有英文photoeyepiece或俄文q0TO字样.使相差显微镜的位相板和环状光栏的调焦中可用调焦望远目镜.这种目镜是两层镜筒相套，可伸可缩的目镜。
偏振光显微镜上可以选配测角目镜。测角目镜的里面装有十字划线，镜简外侧刻有360。刻度的转盘与载物台的360°刻度相配用。组织学教学工作上使用示教目镜很方便.这是一个镜简上方用棱镜分光而由两个或更多数目的接目透镜两人或多人同时观察一个目标的目镜。在目镜内部还装有指示针。所谓的测微目镜实际上在任一种类的目镜中安装目镜测微尺的镜。
物镜(objective)对于麦克奥迪显微镜来说应算比较贵重的部件。一只高性能物镜的价格占这类显微镜本身的1/3-1/2。因为显微镜的基本性能—成像和分辨本领决定于物镜。为了消除成像过程中的球面差和色差、物镜的透镜组由单透镜发展为许多层次的复合透镜组。由3-4透镜已增加到7-9片透镜或透镜复合体。物镜的镜体上都刻有物镜的性能，物镜的镜口率、放大倍数以及特殊物镜的标记字样.消色差物镜的外壳上刻有英，德，法Achromat字样或俄文AXP字样.这种物镜能够消除光谱中的红光和青光所造成的色差而不能消除其他色光形成的色差。
复消色差物镜是性能可以，价格比较贵的物镜.其外壳上刻有英、德、Apochromat(简字Apo)字样或俄文Ail。字样。其透镜质料好，透镜组层次较多，组合得精确能够消除红光、黄光、蓝光造成的色差。这种物镜配用补偿目镜时能够发挥光学显微镜的最高性能。
荧石物镜外壳刻有英、德、法文Fluormat(或Flur)字样.这是能透过紫外光的专用于荧光显微镜的物镜。如果当普通物镜使用，则分辨率太低.
平像场系列物镜刻有Planochromat字样。Opton公司出售的有平像场荧石消色差物镜(Plan-Neofluor)，平像场复消色差物镜(Plan-Achromat)，平像场荧石消色差偏光物镜(Plan-Neofluorpol)等。
相差显微镜必须配备相差物镜.这种物镜刻有英、德、法文Pha或俄文)字样。
单色物镜(monochromat)是全部透镜用融熔水晶制成的贵重物镜。这种物镜是透过紫外线的专用于紫外光干涉显微镜或用于紫外光显微分光光度计上。如果这种物镜不能到手时，可用复消色差物镜代替。
1、生物显微镜的安放应选择干燥清洁的房间，以避免光学部件发霉、金属部分生锈以及粘满灰尘。显微镜使用完毕后，即放回箱(柜)内，或用玻璃罩、塑料套罩住，并放入干操剂。
2、不要自行拆卸生物显微镜各部件；镜筒要插上接目镜或益上镣苗盖，避免灰尘从镜筒上部进入；透镜表面不要用手指碰触或拭擦，如有灰尘，先用柔软毛笔轻轻拂去，再用柔软的清洁细布拭撩，也可用擦镜纸蘸少许二甲苯或石油迷试擦，但注意不要在透镜表面划出条纹。如镜片有轻度长霉，用擦绕纸擦不去时，可用棉签蘸少许70%乙醇与30%乙迷混合液轻轻拭撩。
3、生物显微镜不可与腐蚀性酸类、减类或挥发性强的化学药品放在一起，以免被腐蚀，缩短使用年限。原则上，当观察含液体的标本时，一般都要盖上盖玻片；若液体中含有酸、碱等腐蚀性化学物质时，应把盖玻片的四周用石蜡或凡士林封住，然后观察。但由于进行中药显微鉴定时，经常要用这一类试剂，不可能都封固，因此要特别小心，防止液体流到载物台上，吏不要沾到物镜上。
4、生物显微镜不应在直射阳光下暴晒，也不要放在靠近炉子或暖气的地方，以避免过剧的冷热变化引起透镜和机件的脱胶、变形或损坏。
5、清洁接生物显微镜物镜只限于外表面。接物面被药品污染后即用撩镜纸蘸少许擦镜液拭擦(不要用乙醇)；若背面须清洁时，可用柔软毛笔拂拭，或用皮吸头吸去灰尘。
6、转动粗细调比铝调焦时，动作要缓慢，不要压碎盖被片，以防接物镜和集光器受控击而损坏。
7、使用油镜后，须将镜头上的香柏油拭探干净(可用擦镜纸蘸少许二甲苯拭擦，但注怠二甲苯不能渗入镜头内部，否则二甲苯溶解透镜之间的粘合剂，可使镜片脱落)。
8、反光镜镜面要保护清洁，不要使水、二甲苯或香柏油透入，以免反光镜的水银脱落。
9、加机械部分不灵活，可用细绸布蘸二甲苯少钧：拭去锈和油腻(不得用乙醇，因为这些溶剂会侵蚀油漆)，再用少许液体石服润滑；旋扭过紧不要强行扭动，以免损坏。
10、有时在生物显微镜的视野中发现有污点或异物，可先转动目镜，如果这些污点跟着旋转，则可确定污点是在目镜上；否则，可移动标本片，如污点跟着移动，则污点是在标本片上。如果两者都不是，则污点是在物镜上，可先捡食物镜的前镜头，然后检查后镜头。根据不问情况进行清洁处理。
有时视野的一部分不清晰，这可能是物镜或目镜的前透镜表面有指印或灰尘，也可能是标本片做得不好或显微镜用法不当，如照明系统末调好等原因，应查明情况，分别解决。
11、生物显微镜用毕后，应将各部分擦拭干净，格接物镜转成八字形，然后将镜筒和集光器下降固定，再将反光镜的镜面置垂直的位置。
物体位于物镜前方，离开物镜的距离大于物镜的焦距，但小于两倍物镜焦距。所以，它经物镜以后，必然形成一个倒立的放大的实像A'B'。A'B'靠近F2的位置上。再经目镜放大为虚像A''B''后供眼睛观察。目镜的作用与放大镜一样。所不同的只是眼睛通过目镜所看到的不是物体本身，而是物体被物镜所成的已经放大了一次的像。
倒置显微镜的一些注意事项：
1、显微镜应安装在坚固、水平的桌面上。
2、在使用显微镜观察样品后，要对接触样品部分进行清洁，防止造成污染。
3、更换灯泡时，避免被电击和烧伤，请把主开关设在关O（off）的位置，然后断开电源。若在使用中或使用后需要更换灯泡，请必须在灯及灯箱冷却后进行更换，将灯箱从聚光镜座上面拔下，取下坏的灯泡，更换符合要求的灯泡，否则会降低仪器光学性能。
4、在设备使用完或者出现不正常的时候，应该从插座上拔掉设备电源。
5、显微镜通电时千万不要打开显微镜的下底板，否则显微镜内部的电器元件可能会因外露而导致触电危险。更换显微镜照明灯泡或者保险丝之前，一定要关闭显微镜主电源并将主电源线从电源插座中拔出。否则可能会导致触电。
6、请不要将乙醇、汽油、纸张等易燃物靠近灯泡，以防引起火灾。
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