面对类型如此众多的酶标仪，实验室在选择时往往有难以适从的感觉。
一般来说，用于酶免疫测定比色的酶标仪可分为普通酶标仪，多功能全自动酶标仪和全自动酶免疫分析系统等，普通酶标仪的功能基本上相当于一个微孔板比色计，而多功能全自动酶标仪除了有微孔板比色功能外，还有酶标动力学，紫外乃至凝集等多种检测功能;全自动酶免疫分析系统则有试剂“开放”和“限定”之分，所谓试剂“开放”是指不同品牌的ELISA试剂均可用于该仪器，而试剂“限定”则必须使用仪器专用的酶免测定试剂。
实验室在选择酶标仪时，一般应遵循这样几条原则：
1.根据工作需要去选择
切忌刻意去求功能多，因为一则如果仪器功能过多，易出故障，二则有些功能如酶标动力学或凝集等，可能根本就用不上;如果拟购置的酶标仪主要是用于定性测定，则不必要求完美的定量所需的软件系统。至于全自动酶免疫分析系统则对工作量比较大的血站或大型医院较为适用，对于日常工作量不太大的实验室，就无必要。
2.根据酶标仪的性能去选择
反应酶标仪性能的指标主要有测定波长范围，滤光片配置，检测速度，吸光度范围，线性范围，分辨率，准确度，精密度等。
3.根据自己实验室的财力去选择
酶标仪品种类型多，由于性能不一，价格自然也就相差较大，实验室可根据自己的财力去选择性能/价格比较为合适的酶标仪。
4.根据售后服务去选择
实验室仪器买了以后，就跟我们家里使用的家用电器一样，在使用过程中及使用一段时间之后，很可能就会有保修或维修方面的问题，因此一定要选择售后服务好的公司的酶标仪。
5.根据实验室人员的外语水平去选择
进口酶标仪现有不少已使用中文人机对话，对于英语上有困难的实验室，应尽可能选用此类酶标仪。
确定了选择原则以后，就是怎样去选择了。选择的步骤首先是要获取有关酶标仪的信息资料，一般有这样几条途径：
①向已购不同酶标仪的多家实验室同行咨询访问，获取最直接的使用效果的信息;
②酶标仪销售商的信息广告及介绍;
③权威机构的仪器评估报告。
获取了尽可能多的酶标仪信息资料后，就是对不同类型的酶标仪的性能指标进行比较，选择较为适合本实验室的一种或二，三种再向销售商作进一步的详细咨询了解，以决定选择哪一种进行自检。
酶标仪（MicroplateReader）是对酶联免疫检测（EIA）实验结果进行读取和分析的专业仪器。酶联免疫反应通过偶联在抗原或抗体上的酶催化显色底物进行的，反应结果以颜色显示，通过显色的深浅即吸光度值的大小就可以判断标本中待测抗体或抗原的浓度。
酶标仪广泛地应用在临床检验、生物学研究、农业科学、食品和环境科学中，特别在近几年中，由于大量的酶联免疫检测试剂盒的应用，使得酶标仪在生殖保健领域中应用越来越广泛，同时促进了生殖健康技术水平提高。
目前国内许多计生站系统开展了酶免检测项目，如：乙肝五项、艾滋病检测、优生优育系列检测、激素检测等。过去多数采用目测方法，报出的结果缺乏科学的依据。例如：某弓形虫检测试剂盒中，临界值规定为：阴性对照品的OD值×2.5，通过目测无法判断标本孔的反应颜色是否超过临界值。肉眼进行两孔之间的颜色比较可能还行，但比较一孔的颜色是否超过另一孔颜色的2.5倍就不可能。
国内多家权威机构，如卫生部临床检验中心和计划生育系统等多次强调酶标仪的重要性，并要求酶联免疫检测试剂应使用酶标仪判读，酶免试剂的质控也应使用酶标仪，并提供酶标仪测定的原始数据，而各厂家的试剂盒说明书没有是让用目测的。同时酶免检测的项目往往是一些实质性的感染和病变（如：肝炎、艾滋病、优生优育等），判读更要求严谨，由误诊引起的纠纷很难处理。另外，住院手术病人术前的丙肝、艾滋等EIA试剂检测是避免因输血引起感染引发的医疗事故纠纷的必要手段，正逐渐被许多单位所采用。
酶标仪所用的单色光既可通过相干滤光片来获得，也可用分光光度计相同的单色器来得到。
在使用滤光片作滤波装置时与普通比色计一样，滤光片即可放在微孔板的前面，也可放在微孔板的后面，其效果是相同的。
在酶标仪的操作中应注意以下事项：
1.使用加液器加液，加液头不能混用。
2.洗板要洗干净。如果条件允许，使用洗板机洗板，避免交叉污染。
3.严格按照试剂盒的说明书操作，反应时间准确。
4.在测量过程中，请勿碰酶标板，以防酶标板传送时挤伤操作人员的手。
5.请勿将样品或试剂洒到仪器表面或内部，操作完成后请洗手。
6.如果使用的样品或试剂具有污染性、毒性和生物学危害，请严格按照试剂盒的操作说明，以防对操作人员造成损害。
7.如果仪器接触过污染性或传染性物品，请进行清洗和消毒。
8.不要在测量过程中关闭电源。
9.对于因试剂盒问题造成的测量结果的偏差，应根据实际情况及时修改参数，以达到好的效果。
10.使用后盖好防尘罩。
11.出现技术故障时应及时与厂家联系，切勿擅自拆卸酶标仪。
酶标仪的功能是用来读取酶联免疫试剂盒的反应结果，因此要得到准确结果，试剂盒的使用必须规范。
许多医院在使用酶标仪之前是通过目测判断结果，操作过程随意性较大，在使用酶标仪后如果不能及时纠正操作习惯，会造成较大误差。
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