在选择气相色谱仪进样方式时，应充分考虑分析准确性、实用性、经济性的原则，要选择有最高性价比的产品方式，如果被测组分的性质：如热不稳定、易分解、易催化反应的样品，要考虑时间、温度、压力等变化是否会引起被测样品组分的变化，可考虑冷柱上进样或手动进样，后者亦选择自动进样器方式，但是都要用针尖很细的进样器，色谱工程师认为，可从以下几个方面考虑。
　　一、色谱分析样品的性质
　　1.样品的组分和状态：可能为气态、液态、固态、或是混合态、要考虑是否能够直接用气相色谱仪分析。对于常规的气态、液态样品，能够直接进行分析的，可选用微量手动进样器、液体自动进样器或者阀进样器系统；如对分析结果要求高时的，气态样品可选择气体阀进样；如果对装备中的在线液体进样，可选择液体阀进样器；测定固态或者混合态样品中的挥发性组分，可根据实验室条件和实验目的，选择顶空进样器或者吹扫捕集进样系统。
　　2.被测组分的性质：如热不稳定、易分解、易催化反应的样品，要考虑时间、温度、压力等变化是否会引起被测样品组分的变化，可考虑冷柱上进样，可选择手动进样后者自动进样方式，但是都要用针尖很细的进样器。
　　3.样品中的杂质：是否有烟尘、悬浮物、高沸点组分或腐蚀性成分等，如有，要考虑样品的来源，并进行前处理，可选择能进行样品前处理的进样系统如固相微萃取进行系统、吹扫捕集进样系统，或者顶空进样系统等。
　　4.样品来源是否容易：如可消耗的样品组分多，将有利于选择进样方式。
　　二、色谱分析样品的目的
　　1.定性分析：要考虑被分析组分是否已知，有无标准样品，对进样系统要求高不高。
　　2.定量分析：在哪个定量范围，如常量、半微量、微量还是痕量或者超痕量。如是痕量或超痕量等对定量要求高的，则要选择进样准确且干扰因素少的进样方式。如气体进样可选择气体阀进样系统。
　　3.定量精密度和结果的准确度：若是定义要求就简单得多。
　　根据以上几点选择进样方式，就要求进样系统要准确和经济实用为主。