电磁流量计稳定性比较高，一般很少发生故障，但由于环境条件的变化或安装工况条件所限。
也可能发生一些问题或故障，应该加以解决或避免，大致主要表现为以下几种情况：
1、被测水的流速过低，由此影响测量的精度。特别是在一些区域边界安装的电磁流量计，由于处于区域公司管网末梢，压差小而造成流速过低。其解决办法是尽量开启边界两边阀门。
2、没有满足流量计的安装条件，电磁流量计对管道的直管段要求较高，在新建水厂设计时可以尽量满足，而对老水厂改造或加装来说，以上条件就变得几乎苛刻。由此影响了测量稳定性。其解决方法为加装整流管以改善流动特性。
3、安装在原水管道中电磁流量计的传感器电极表面被淤泥沉积污染，影响测量。其解决方法为选用自动清理式电极，并定期进行维护清洗。
4、管道水中有气，造成电磁流量计测量波动大影响稳定性。其解决办法要设法找到气的来源并加以解决，必要时在管道中加装排气阀。
5、电磁流量计入口管道中异物堆积，造成被测水体流动特性突变由此影响测量精度造成较大的误差。其解决方法为及时清除管道中堆积的异物。
6、雷击造成电磁流量计的转换器损坏，以致无法测量。其解决办法为在转换器信号输人端、励磁电流输人端和工作电源端分别加装相应的避雷器。
电磁流量计在运行中常见的故障有两种：一是仪表本身故障， 即仪表结构件或元器件损坏引起的故障；二是由外部原因引起的故障，如安装不妥流动变化、沉积和结垢等。
1、每月对孔板阀检查排污一次，清除孔板表面污物，目测孔板重要部位，如有划伤、蚀坑、磨损等缺陷，应予以更换，密封件如有损伤变形必须更换,孔板的排污清洗要做好记录。
2、差压值严格控制在差压变送器量程的10%-90%之间可以在30%-70%），超出范围需及时更换孔板。
3、严格执行公司巡检制度。差压变送器五阀组检查：检查五阀组高低压阀腔有无漏气，关闭根部阀打开平衡阀后检查零点有无漂移。冬季气温低每月对引压管进行放空、吹扫，防止引压管内积聚污物。
4、根据生产科的要求及时对气质组分进行更改，流量计算机的操作严格按照作业指导书操作。
5、定期校验温度变送器、差压变送器、压力变送器等相关计量仪表。
电磁流量计不使用的时候，我们也要对电磁流量计采取科学合理的维护和保养方法。
一、电磁流量计维护之定期检查传感器电性能：
首先，粗略地测量电极间电阻。断开传感器与转换器间信号连线，传感器内充满液体，用万用表测量两电极与接地端的电阻值，是否在制造厂规定值范围内，且所测得两值大体相同。
记录下首次测量的电阻值，此值对以后判断传感器故障原因(如沉积层是导电的还是绝缘的)是有用的。
其次，将传感器放空液体，擦净内壁，待完全干燥后用兆欧计测量两电极和接地端子间的电阻。
最后，检查激磁线圈绝缘电阻，卸下传感器激磁线圈，将端子与转换器间接线，用兆欧计测量线圈的绝缘电阻
二、电磁流量计维护之零点检查和调整：
电磁流量计投入运行前，通电后必须在电磁流量传感器充满液体静止状态下调整零点。投入运行后亦要针对使用条件定期停流作零点检查；尤其对沉淀、易污染电极，含有固相的非清洁液，在运行初期应多作检查，以获得经验确定正常检查周期。交流激磁方式的电磁流量计与矩形波激比，更易产生零点漂移，因此更要注意检查和调整。
举两个个沉积层产生故障的应用失误的例子。一个是石油钻探固井工程中，灌注水泥浆的流总量是重要工艺参数，经常用高压电磁流量计。仪表间歇使用，用毕后以清水冲洗传感器测量管，其余时间是空管。由于清洗不彻底，测量管内壁残留水泥浆固化成薄层，近二个月积聚形成绝缘层，包覆了整个电极表面，导致运行不正常到最终不能工作。
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