激光共聚焦显微镜是在荧光显微镜成像基础上加装了激光扫描装置，利用计算机进行图像处理；
把光学成像的分辨率提高了30%--40%，使用紫外或可见光激发荧光探针，从而得到细胞或组织内部微细结构的荧光图像；
在亚细胞水平上观察诸如Ca2+ 、PH值，膜电位等生理信号及细胞形态的变化，成为形态学，分子生物学，神经科学，药理学，遗传学等领域中新一代强有力的研究工具。
激光共聚焦成像系统能够用于观察各种染色、非染色和荧光标记的组织和细胞等，观察研究组织切片，细胞活体的生长发育特征，研究测定细胞内物质运输和能量转换。
能够进行活体细胞中离子和PH值变化研究(RATIO)，神经递质研究，微分干涉及荧光的断层扫描，多重荧光的断层扫描及重叠；
荧光光谱分析荧光各项指标定量分析荧光样品的时间延迟扫描及动态构件组织与细胞的三维动态结构构件；
荧光共振能量的转移的分析，荧光原位杂交研究(FISH)，细胞骨架研究，基因定位研究，原位实时PCR产物分析，荧光漂白恢复研究(FRAP)，胞间通讯研究，蛋白质间研究，膜电位与膜流动性等研究，完成图像分析和三维重建等分析。
基本原理
传统的光学显微镜使用的是场光源，标本上每一点的图像都会受到邻近点的衍射或散射光的干扰；
激光共聚焦显微镜利用激光束经照明针孔形成点光源对标本内焦平面的每一点扫描，标本上的被照射点；
在探测针孔处成像，由探测针孔后的光点倍增管(PMT)或冷电耦器件(cCCD)逐点或逐线接收，迅速在计算机监视器屏幕上形成荧光图像。
照明针孔与探测针孔相对于物镜焦平面是共轭的，焦平面上的点同时聚焦于照明针孔和发射针孔；
焦平面以外的点不会在探测针孔处成像，这样得到的共聚焦图像是标本的光学横断面，克服了普通显微镜图像模糊的缺点。
荧光显微镜是荧光显微检测的专用工具，它是光学显微镜的一种。它除了具有光学显微镜的基本结构和光学放大作用外，基于荧光的特性，还具备以下独特的功能要求: 1、提供足够能量的能激发出荧光的光源。 2、有着适应不同物质所需的激发光谱一组滤色片，从光源中选择合适的激发光谱，使析出的光谱与该物质的吸收光谱重合，以期望获得最大的荧光。 3、为获得较弱的荧光图像，还要建立一套截止滤色片，它使所需观察的荧光进入系统成像，而将其余的光波，包括发射光阻挡在外，用来提高图像的衬度。 4、放大的光学系统应适应荧光的特性，最终获得既能观察又能摄影的高亮度、高分辨力的良好衬度的荧光图像。 5、仪器的安全性。应用汞灯要防止紫外线的泄漏和汞灯的爆炸，保证电器安全。
倒置显微镜和放大镜起着同样的作用，就是把近处的微小物体成一放大的像，以供人眼观察。只是显微镜比放大镜可以具有更高的放大率而已。
物体位于物镜前方，离开物镜的距离大于物镜的焦距，但小于两倍物镜焦距。所以，它经物镜以后，必然形成一个倒立的放大的实像A'B'。A'B'靠近F2的位置上。再经目镜放大为虚像A''B''后供眼睛观察。目镜的作用与放大镜一样。所不同的只是眼睛通过目镜所看到的不是物体本身，而是物体被物镜所成的已经放大了一次的像。
倒置显微镜中常用的观察方法就是相差。由于这种方法不要求染色，是观察活细胞和微生物的理想方法。在此提供各种聚光器来满足需要，这种方法提供带有自然背景色的、高对比度的、高清晰度的图像。
操作使用：
1.开机。接连电源。打开镜体下端的电控开关。
2.使用
（1）准备：将待观察对象置于载物台上。旋转三孔转换器，选择较小的物镜。观察，并调节铰链式双目目镜，舒适为宜。
（2）调节光源：推拉调节镜体下端的亮度调节器至适宜。通过调节聚光镜下面的光栅来调节光源的大小。
（3）调节像距：转三孔转换器，选择合适倍数的物镜；更换并选择合适的目镜；同时调节升降，以消除或减小图像周围的光晕，提高了图像的衬度。
（4）观察：通过目镜进行观察结果；调整载物台，选择观察视野。
3.关机
取下观察对象，推拉光源亮度调节器至最暗。关闭镜体下端的开关，并断开电源。旋转三孔转换器，使物镜镜片置于载物台下侧，防止灰尘的沉降。
日常维护及注意事项：
1.所有镜头表面必须保持清洁，落在镜头表面的灰尘，可用吸耳球吹去，也可用软毛刷轻轻的掸去掉。
2.当镜头表面沾有油污或指纹时，可用脱脂棉蘸少许无水乙醇和yi醚的混合液（3:7）轻轻擦拭。
3.不能用有机溶液清擦其它部件表面，特别是塑料零件，可用软布蘸少量中性洗涤剂清擦。
4.在任何情况下操作人员不能用棉团、干布块或干镜头纸擦试镜头表面，否则会刮伤镜头表面，严重损坏镜头，也不要用水擦试镜头，这样会在镜头表面残留一些水迹，因而可能滋生霉菌，严重损坏显微镜。
5.仪器工作的间歇期间，为了防止灰尘进入镜筒或透镜表面，可将目镜留在镜筒上，或盖上防尘塞，或用防尘罩将仪器罩住。
6.微镜尽可能不移动，若需移动应轻拿轻放，避免碰撞。
7.不允许随意拆卸仪器，特别是中间光学系统或重要的机械部件，以免降低仪器的使用性能。
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