生物显微镜是用来观察生物切片、生物细胞、细菌以及活体组织培养、流质沉淀等的观察和研究，同时可以观察其他透明或者半透明物体以及粉末、细小颗粒等物体。它的正常使用离不日常维护，包括：
生物显微镜的安放应选择干燥清洁的房间，以避免光学部件发霉、金属部分生锈以及粘满灰尘。显微镜使用完毕后，即放回箱（柜）内，或用玻璃罩、塑料套罩住，并放入干操剂。
生物显微镜不可与腐蚀性酸类、减类或挥发性强的化学药品放在一起，以免被腐蚀，缩短使用年限。原则上，当观察含液体的标本时，一般都要盖上盖玻片;若液体中含有酸、碱等腐蚀性化学物质时，应把盖玻片的四周用石蜡或凡士林封住，然后观察。但由于进行中药显微鉴定时，经常要用这一类试剂，不可能都封固，因此要特别小心，防止液体流到载物台上，吏不要沾到物镜上。
不要自行拆卸生物显微镜各部件;镜筒要插上接目镜或益上镣苗盖，避免灰尘从镜筒上部进入;透镜表面不要用手指碰触或拭擦，如有灰尘，先用柔软毛笔轻轻拂去，再用柔软的清洁细布拭撩，也可用擦镜纸蘸少许二甲苯或石油迷试擦，但注意不要在透镜表面划出条纹。如镜片有轻度长霉，用擦绕纸擦不去时，可用棉签蘸少许70%乙醇与30%乙迷混合液轻轻拭撩。
生物显微镜不应在直射阳光下暴晒，也不要放在靠近炉子或暖气的地方，以避免过剧的冷热变化引起透镜和机件的脱胶、变形或损坏。
清洁接物镜只限于外表面。接物面被药品污染后即用撩镜纸蘸少许擦镜液拭擦（不要用乙醇）;若背面须清洁时，可用柔软毛笔拂拭，或用皮吸头吸去灰尘。
使用油镜后，须将生物显微镜镜头上的香柏油拭探干净（可用擦镜纸蘸少许二甲苯拭擦，但注怠二甲苯不能渗入镜头内部，否则二甲苯溶解透镜之间的粘合剂，可使镜片脱落）。
加机械部分不灵活，可用细绸布蘸二甲苯少钧：拭去锈和油腻（不得用乙醇，因为这些溶剂会侵蚀油漆），再用少许液体石服润滑;旋扭过紧不要强行扭动，以免损坏。
1、使用时，被检物体做的较标准很重要。如：切片厚度是否太厚，盖玻片是否符合国标等。
2、显微镜物镜按档次可分为约6-8个档，常用的为平场消色差物镜。如镜头档次太低，则成像质量会下降。因此，建议选择平场以上档次物镜。
3、聚光镜孔径光栏，尽量和物镜的数值孔径相符。才能得到较佳的图像分辨率。
4、调焦系统作为机械部分的重要部件，调焦精度也非常重要。对于生物学初学者或刚接触显微镜的操作者，熟练的使用调焦系统，能快速找到图像并聚焦，提高工作效率。
5、载物台在观察切片时，常做X，Y的移动。如：双层的机械移动平台，精度和稳定性较好，能在观察显微图像时提供好的成像质量。
6、非球面集光镜能提供非常均匀的照明光线，所观察到的显微图像衬度极佳。
7、视场光栏应根据观察不同的被检物体和物镜倍率开启到合适的位置，如开得过大或过小显微图像的视场亮度会受到影响。
8、照明系统如采用温度低，色温较高的照明装置，观察到的是分辨率和锐利度极高的显微图像。
9、采用柯拉照明系统，能调节光学的中心像。科研级的显微镜均采用此系统，为镜检和专业数码显微成像系统，提供优质的显微照片。
工具显微镜是一种以光学(显微镜)瞄准和坐标(工作台)测量为基础的机械式光学仪器，可用于测量各种长度和角度；
特别适合于测量各种复杂的工具和零件，如螺纹、凸轮的轮廓、切削刀具和孔间距等,应用范围很广。
主要分为:
小型工具显微镜、大型工具显微镜、万能工具显微镜和重型万能工具显微镜等4 种类型。
它们都有工具显微镜的基本特点,除了测量范围和分度值有所区别外,其他如工作台的承载能力、附件种类和数量和仪器精度等都有所不同。
工具显微镜保养维护：
显微镜在不用的状态下，用塑料袋包起来，然后在塑料带里放1~2包干燥剂，干燥剂一般都在旺旺饼干里或月饼的盒子里，都有干燥剂，显微镜在放到通风的环境下就可以了，物镜镜头要定期擦。
工具显微镜是很精密的测量仪器，如果保养的不好，将会很大程度的降低其使用寿命和精度。
以下是提供的的保养和维护建议
1、环境：
工具显微镜*好能够放置在清洁干净的场所，但一般使用在机械工厂的机会很多，故应注意下列各点：
（1）一般照明不要超过必要的亮度。
（2）不会沾油污的地点。
（3）灰尘少的地点。
（4）振动少的场所。
（5）不会发生温度急剧变化的地点。
2、玻璃零组件：
玻璃零件应随时保持清洁，不可沾上污垢，否则生像不清晰而且降低测定精度。
（1）镜头：
平时应该注意不要用手触碰镜头，假若镜头表面沾有手纹或油污，可用镜头清洁剂或者用纱布浸湿酒精轻轻擦拭，如果不了解镜头者请不要随意分解，些微的灰尘是不会影响测定效果。
（2）测量台座玻璃：
放置测定物时最容易伤及此部的玻璃面，故要特别注意。若沾上油垢或灰尘请用柔软拭布擦拭。还有，对物透镜及观测透镜之使用要十分注意。
当从显微镜拆卸观测透镜时容易使显微镜的活动焦距沾上灰尘，故纵然不使用也要把观测透镜装在显微镜上。
3、电气零件：
工具显微镜必须使用较高压的电流，假若接触不良容易产生热，易发生危险，所以必须随时检查，原则上主机必须接地。
4、消耗品及附件：
灯泡及电源保险丝是属于消耗品，购置时应准备备品以利更换。附件则以测定台玻璃重要，也须准备备品。
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