1、使用时，被检物体做的较标准很重要。如：切片厚度是否太厚，盖玻片是否符合国标等。
2、显微镜物镜按档次可分为约6-8个档，常用的为平场消色差物镜。如镜头档次太低，则成像质量会下降。因此，建议选择平场以上档次物镜。
3、聚光镜孔径光栏，尽量和物镜的数值孔径相符。才能得到较佳的图像分辨率。
4、调焦系统作为机械部分的重要部件，调焦精度也非常重要。对于生物学初学者或刚接触显微镜的操作者，熟练的使用调焦系统，能快速找到图像并聚焦，提高工作效率。
5、载物台在观察切片时，常做X，Y的移动。如：双层的机械移动平台，精度和稳定性较好，能在观察显微图像时提供好的成像质量。
6、非球面集光镜能提供非常均匀的照明光线，所观察到的显微图像衬度极佳。
7、视场光栏应根据观察不同的被检物体和物镜倍率开启到合适的位置，如开得过大或过小显微图像的视场亮度会受到影响。
8、照明系统如采用温度低，色温较高的照明装置，观察到的是分辨率和锐利度极高的显微图像。
9、采用柯拉照明系统，能调节光学的中心像。科研级的显微镜均采用此系统，为镜检和专业数码显微成像系统，提供优质的显微照片。
生物显微镜与金相显微镜的区别在哪里，好多对显微镜不熟悉的人会问道这个问题，导致他们在选择显微镜的时候造成一定的困恼，
生物显微镜与金相显微镜的区别：
首先他们用来观察的物体不一样，金相显微镜用于工业，主要观察金属、岩矿等的内部组织、及半导体、电子工业进行晶体、集成电路的检验和科学研究。
生物显微镜与金相显微镜的区别生物显微镜用于学校、医院、广泛应用于生物、病理、细菌、组织、免疫、遗传等教学、临应实验的领域。生物显微镜用的是透射照明，一般用来观察透时和半透明的样本，不能用来观察不透明物体，而金相显微镜主要是落射照明方式（也叫同轴照明），光源从物镜射出，主要用于观察不透明样本的表面，当然也有附带透射照明装置的较高级金相显微镜，可同时用于观察透明样本。所以在选择显微镜的同时要先了解观察的物体，根据不同显微镜观察不同的物体来选配比较合适您的显微镜。
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