除灵敏度（即最低检测限）比HPLC柱前衍生方法稍低以外（HPLC<0.5pmol氨基酸分析仪：<10pmol其他如分离度、重现性、操作简便性、运行本钱等方面，分析效果：从目前已知的氨基酸分析方法比拟来看。都优于其他分析方法。
对蛋白质水解液及各种游离氨基酸的组分含量进行分析。仪器基本结构同普通HPLC相似，采用经典的阳离子交换色谱分离、茚三酮柱后衍生法。但针对氨基酸分析进行了细节优化（例如氮气维护、惰性管路、线脱气、洗脱梯度及柱温梯度控制等等）
速度较快，通常细分为两种系统：蛋白水解分析系统（钠盐系统）和游离氨基酸分析系统（锂盐系统）利用不同浓度和pH值的柠檬酸钠或柠檬酸锂进行梯度洗脱。其中钠盐系统一次较多分析约25种氨基酸。基线平直度好；锂盐系统一次较多分析约50种氨基酸，速度较慢，基线一般不如钠盐系统好。
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微量硫分析不仅可作形态硫分析，而且可用反吹法测定总硫。总硫结果可用0~10mV、4~20mA标准信号送出，用于远程显示或与上位机联网。由于有采样数字滤波，大大降低基线噪音，提高分析灵敏度。另外，该机还配有自动进样系统，可作为在线色谱仪使用。
在氨厂的应用：
用火焰光度检测器的气相色谱法分析氨厂原料气及脱硫后气体中硫化物是一种常用的方法，有很高的选择性和灵敏度，能对样品中硫化物分别分离，这对硫化物形态研究非常有利。但氨厂气体中硫化物的组份是很复杂的，尤其是有机硫组份很多，相对保留时间相差几十倍，其中二硫化物保留时间就要40~50分钟以上，要准确定性定量是很困难的。这是硫化物在火焰光度检测器上的非线性而决定的。一般用面积或峰高定量必须每种组分制做一个工作曲线，每个工作曲线至少要三种以上含量的标准样品来绘制。获得大量的纯物质和标准样品几乎是不可能的。往往只能采用简约或近似方法。
微量硫分析仪是专为硫分析而研制的，仪器自带计算机能够采用响应值开方后累加的面积处理方式，解决了硫分析的线性关系,只要一种标样就能对常见的硫化物定量,并且可以采用反吹法快速分析总硫。
在食品级二氧化碳分析的应用：
食品级二氧化碳中硫化物含量是一个重要指标，硫化物不仅影响饮料的口味，而且还对人体有害。国外食品级二氧化碳中硫化物含量有严格的要求，其中英国BOC标准、美国Airco标准都要求H2S<0.5×10-6（v/v,下同）、COS<0.5×10-6;SO2<0.5×10-6，这还是以前的标准。最近美国的可口可乐公司将其标准大大的提高，不但要求H2S<0.1×10-6、COS<0.1×10-6;SO2<0.1×10-6，而且要求总硫也要低于0.1×10-6，就是说硫醇、硫醚、二硫化碳等硫化物也要低于0.1×10-6。过去我国对食品级二氧化碳中硫化物含量没有作规定。随着改革开放，国外饮料公司大量涌入，象可口可乐、百事可乐在中国建立了许多灌装厂都要用到食品级二氧化碳。如果我国生产的二氧化碳中硫化物含量达不到标准，将无法打入这些公司。正在修定中的我国食品级二氧化碳中硫化物含量标准也将考虑采用可口可乐公司相当的标准。
在天然气中硫化物分析的应用：
用火焰光度检测器的气相色谱法分析天然气中硫化物是一种常用的方法，有很高的选择性和灵敏度，能对样品中硫化物分别分离，这对硫化物形态研究非常有利。但天然气样品中硫化物的组份是很复杂的，尤其是有机硫组份很多，相对保留时间相差几十倍，其中二硫化物保留时间就要40~50分以上，要准确定性定量是很困难的。在工厂中正常操作时大多数情况对硫化物形态并不关心，关心的是气体中的总硫含量。采用常规的方法分析不仅浪费时间而且往往漏检重组份硫化物，这是因为重组份的硫化物出峰时间晚、峰形扁,含量低时往往被基线噪音掩盖。本仪器色谱反吹法快速检测天然气样品中总硫含量。
液化气中硫化物分析的应用：
用微量硫分析仪分析液化气中的硫化物过去没有做过，要分析液化气中硫化物有一定难度，这是由于液化气中存在大量的烃类物质，对硫化物干扰比较厉害，再则液化气由于来源不同组分相差很远。据北京三聚公司的人介绍惠谱公司的毛细管色谱柱都不能把羰基硫与碳三，碳四化合物分开。因此能找到一个比较好的色谱柱和适当的操作条件是个关键，而且难度就在羰基硫与碳四的分离，尤其是羰基硫与碳三烯烃的分离。
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