原子荧光光度计将样品溶液中的待分析元素还原为挥发性共价气态氢化物（或原子蒸汽），然后借助载气将其导入原子化器，在氩—氢火焰中原子化而形成基态原子。
基态原子吸收光源的能量而变成激发态，激发态原子在去活化过程中将吸收的能量以荧光的形式释放出来，此荧光信号的强弱与样品中待测元素的含量成线性关系,因此通过测量荧光强度就可以确定样品中被测元素的含量。
仪器正常的使用，除了对仪器要足够了解，也要对仪器维护清洁：
1、严格遵循开、关机程序。
2、观察管路的密闭性能，如果管路漏液应及时停止转泵，查清漏源再次连接好管路，应及时清除漏液避免液体腐蚀仪器表面。
3、为了自身健康和环境请你及时处理废液。
4、测试完成以后，用去离子水清洗泵管和注射针管，并及时取下蠕动泵泵管卡，避免泵管长时间压制变形而影响其寿命。变形后可用10%盐酸浸泡48小时，用去离子水清洗干净备用。
5、泵管使用一段时间后，应随时向泵管与泵头间的空隙滴加随机提供的硅油，以保护泵管。
6、仪器的表面清洁 仪器的外壳表面经过了喷漆、及喷塑工艺的处理，在使用过程中请不要将溶液遗洒在外壳上， 否则会在外壳上留下斑痕， 如果不小心将溶液遗洒在外壳上请立即用湿毛巾擦拭干净，杜绝使用有机溶液擦拭。
7、仪器长期不用时，需每隔1个月预热仪器半小时左右(在测量状态下预热才有用)，有助于延长灯及仪器的寿命。
8、气液分离器和加热石英管为石英玻璃件，应避免碰撞以免破碎，使用过程中可用10%盐酸浸泡24小时来清除杂质，用去离子水清洗干净晾干备用。
除了核酸浓度，分光光度计同时显示几个非常重要的比值表示样品的纯度，如A260/A280的比值，用于评估样品的纯度，因为蛋白的吸收峰是280nm。纯净的样品，比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8或者2.0，表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A230表示样品中存在一些污染物，如碳水化合物，多肽，苯酚等，较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0。A320检测溶液的混浊度和其他干扰因子。纯样品，A320一般是0。
蛋白质的直接定量(UV法)
这种方法是在280nm波长，直接测试蛋白。选择Warburg公式，光度计可以直接显示出样品的浓度，或者是选择相应的换算方法，将吸光值转换为样品浓度。蛋白质测定过程非常简单，先测试空白液，然后直接测试蛋白质。由于缓冲液中存在一些杂质，一般要消除320nm的“背景”信息，设定此功能“开”。与测试核酸类似，要求A280的吸光值至少大于0.1A，较佳的线性范围在1.0-1.5之间。实验中选择Warburg公式显示样品浓度时，发现读数“漂移”。这是一个正常的现象。事实上，只要观察A280的吸光值的变化范围不超过1%，表明结果非常稳定。漂移的原因是因为Warburg公式吸光值换算成浓度，乘以一定的系数，只要吸光值有少许改变，浓度就会被放大，从而显得结果很不稳定。蛋白质直接定量方法，适合测试较纯净、成分相对单一的蛋白质。紫外直接定量法相对于比色法来说，速度快，操作简单;但是容易受到平行物质的干扰，如DNA的干扰;另外敏感度低，要求蛋白的浓度较高。
比色法蛋白质定量
蛋白质通常是多种蛋白质的混合物，比色法测定的基础是蛋白质构成成分：氨基酸(如酪氨酸，丝氨酸)与外加的显色基团或者染料反应，产生有色物质。有色物质的浓度与蛋白质反应的氨基酸数目直接相关，从而反应蛋白质浓度。
一、开机 开机前将样品室内的干燥剂取出，确认电源是否连接。打开仪器电源开关，等待仪器自检通过，自检过程中禁止打开样品室。 二、使用 仪器自检结束后(7个自检项目均出现OK字样)，按[MAINMENU]键(主菜单)，屏幕显示如下5个功能项： 1、Phtometry(定量运算); 2、WavelengthScan(波长扫描模式); 3、TimeScan(时间曲线扫描); 4、System(系统校正);5、Datadisplay(光度直接测量模式)。按相应选项前的数字键，即可进入该选项的下一级子菜单。 1、Phtometry(定量运算) 1)按[MAINMENU]键，再按数字[1]键进入Phtometry子菜单下，选中对应的数字来选择所需的测定方式： ①%T/ABS(透过率/吸光度测定模式); ②Ratio(比例测定模式); ③Concentration(浓度测定模式或标准曲线模式); 2)按数字[1]键进入%T/ABS(透过率/吸光度测定)子菜单，选中对应的数字键来设定测定条件：①NUMWL(设定测试波长的数目，较多可设定6个不同波长); ②WLSetting(设定测试波长具体数值)③DataMode(选择测定吸光度或透光率)，设定完毕后点击[Enter]键确定，所有项目设定完毕后按数字[0]键确定，等待仪器调整至准备状态，此时屏幕上出现AUTOZERO，将盛有空白溶液的比色皿放入样品室中，按[Start/Stop]键进行零点的自动调整，自动调零完成后，将样品置于光路中，再按[Start/Stop]键进行测量，仪器的显示屏自动给出对应波长的数值。 3)按数字[3]键进入③Concentration(浓度测定模式或标准曲线模式)，选中对应的数字来设定条件(波长数目，波长数值，标准溶液数目及浓度)，设定完毕后点击[Enter]键确定，所有项目设定完毕后按数字[0]键确定，等待仪器调整至准备状态，此时屏幕上出现AUTOZERO，将盛有空白溶液的比色皿放入样品室中，按[Start/Stop]键进行零点的自动调整，自动调零完成后，将标准溶液置于光路中，按照浓度从低到高顺序依次按[Start/Stop]键进行测量，测量完毕后仪器将自动给出标准曲线，标准曲线下方有三项供选择：①Process(更改标准曲线的坐标和观察浓度回归曲线的数据);②Measure(直接进入样品的测量);③Print(打印浓度回归曲线谱图和数据)，选中对应的数字就可执行相应的功能。 4)如果希望返回上一级菜单，按[CLEARRETURN]键返回，返回主菜单直接按[MAINMENU]键。 2、WavelengthScan(波长扫描模式) 1)参数修改：按[MAINMENU]键，再按数字[2]键进入②WavelengthScan(波长扫描模式)子菜单下，选中对应的数字来选择所需修改的内容，修改扫描的起始波长，测量模式，图谱坐标的上下限，扫描速度等等。修改完毕按数字[0]键确定。 2)波长扫描：分别将两个比色皿装上空白溶液和样品溶液，放入比色槽中，按[Start/Stop]键进行谱图扫描(如想终止扫描再次按按[Start/Stop]键)，待仪器自动进行基线校正，提示拉入样品自动测试，测试完毕后有扫描图谱出现，下方有相应的数据处理选项①Process②Baseline③Print; 3)数据处理：按数字[1]键进入①Process(数据处理)，可以读峰谷值，修改坐标，显示所有数据，求一阶倒数等等功能。 3、TimeScan(时间曲线扫描) 同上(二)操作。 4、System(系统校正) 一般不做。 5、Datadisplay(光度直接测量模式) 同上(二)操作。 三、关机 将比色皿中的溶液倒尽，然后用蒸馏水或有机溶剂冲洗比色皿至干净;关电源将干燥剂放入样品室内，盖上防尘罩，做好使用登记，得到管理人员认可方可离开。
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