液相色谱仪由高压液体泵、检测器及液相色谱柱等三部分组成，其中液相色谱柱的正确安装和使用，是液相色谱工作的关键；也是液相色谱工作者获得正确可靠的实验数据的必经之路。
色谱柱的安装：
1.将液相色谱装置中的流动相完全置换后再连接色谱柱，并完全排出流路内的空气。装置内的液体和所使用的流动相不能相溶的情况下，使用双方都能相溶的液体做过渡。。将盐溶液置换成有机溶剂的时候，需要通过纯水、丙酮的顺序来进行置换。相反，从有机溶剂转换成盐溶液的情况下，需要通过丙酮、纯水的顺序置换。
2.色谱柱保存方法不对或者长期不使用的情况下，色谱柱的出入口可能会有空气残留。这种情况下，必须先把空气完全排出后才连接到装置中。避免快速加热，加热温度不要超过色谱柱的Z高负荷温度。把柱子入口侧的螺栓打开，然后加温(一般加温到手心感到温暖的程度就足够了)，等液体满出来以后接到装置上。然后，打开出口处的螺栓，用泵送液，等确认出口处有液体流出后，连接到装置中。这样操作，就算后面再连接一根色谱柱也能完全除去空气。
3.在泵运作的时候连接色谱柱。确保能让流动相按照色谱柱上箭头的方向流动的状态连接色谱柱。
4.色谱柱加温使用的时候，先用0.2～0.3mL/min的低流量一边送液一边升温。达到所定温度后，再渐渐的增加流量至测定流量。
色谱柱的安装：
1)将液相色谱装置中的流动相完全置换后再连接色谱柱，并完全排出流路内的空气。
装置内的液体和所使用的流动相不能相溶的情况下，使用双方都能相溶的液体做过渡。比如从水置换到氯仿的情况，就需要使用丙酮做过渡，才能完全置换。
将盐溶液置换成有机溶剂的时候，需要通过纯水、丙酮的顺序来进行置换。相反，从有机溶剂转换成盐溶液的情况下，需要通过丙酮、纯水的顺序置换。
不仅仅是泵，流动相流动的所有流路都必须进行置换。例如，注入样品的情况，软管内的液体也需要置换。另外，如果使用压力计等别的软管的情况，取下来的管子也必须由流动相洗净后才能继续使用。
2)色谱柱保存方法不对或者长期不使用的情况下，色谱柱的出入口可能会有空气残留。这种情况下，必须先把空气完全排出后才连接到装置中。
避免快速加热，加热温度不要超过色谱柱的最高负荷温度。
把柱子入口侧的螺栓打开，然后加温(一般加温到手心感到温暖的程度就足够了)，等液体满出来以后接到装置上。然后，打开出口处的螺栓，用泵送液，等确认出口处有液体流出后，连接到装置中。这样操作，就算后面再连接一根色谱柱也能完全除去空气。
3)在泵运作的时候连接色谱柱。确保能让流动相按照色谱柱上箭头的方向流动的状态连接色谱柱。
4)色谱柱加温使用的时候，先用0.2～0.3mL/min的低流量一边送液一边升温。达到所定温度后，再渐渐的增加流量至测定流量。
5)色谱柱需要安定时间。连接到装置中立即进行测试的情况下，第一次很难得到好的分析结果。
阳离子色谱柱是高效液相色谱的一种，是分析阴阳离子的一种液相色谱方法，该方法具有选择性好、灵敏、快速、简便等优点，并且可以同时测定多种组分。
阳离子色谱柱的进样系统
离子色谱的进样主要分为3种类型：即气动、手动和自动进样方式。
手动进样阀
手动进样采用六通阀，其工作原理与HPLC相同，但其进样量比HPLC要大，一般为50μL。样品首先以低压状态布满定量管，当阀沿顺时针方向旋至另一位置时，即将贮存于定量管中固定体积的样品送进分离系统。
气动进样阀
气动阀采用一定氦气或氮气气压作动力，通过两路四通加载定量管后，进行取样和进样，它有效地减少了手动进样因动作不同所带来的误差。
自动进样
自动进样器是在色谱工作站控制下，自动进行取样、进样、清洗等一系列操纵，操纵者只须将样品按顺序装进贮样机中。圆盘式自动进样的工作步骤如下：
(1)电机带动贮样盘旋转，待分析样品置于取样针正下方。
(2)电机正转，丝杆带动滑块向下移，把取样针插进样品塑料盖，滑块继续下移，将瓶盖推进瓶内，在瓶盖挤压下样品经管道流进进样阀定量管，完成取样动作。
(3)进样阀切换，完成进样。
(4)电机反转，丝杆带动滑块上移，取样针恢复原位。
自动进样可以达到很宽的样品进样量范围的目的。
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