1、减压阀的安装
有的仪器随机带有减压阀，若没有的则要购买。所用的是2只氧气，1只氢气减压阀。将2只氧气减压阀，1只氢气减压阀分别装到氮气，空气和氢气钢瓶上注意氢气减压阀螺纹是反向的，并在接口处加上所附的O形塑料垫圈，以便密封、，旋紧螺帽后，关闭减压阀调节手柄即旋松、，打开钢瓶高压阀，此时减压阀高压表应有指示，关闭高压阀后，其指示压力不应下降，否则有漏，应及时排除用垫圈或生料带密封、，有时高压阀也会漏，要注意。然后旋动调节手柄将余气排掉。
2、外气路连接法
把钢瓶中的气体引入色谱仪中，有的采用不锈钢管φ2×0.5mm、，有的采用耐压塑料管φ3×0.5mm、。采用塑料管容易操作，所以一般采用塑料管。若用塑料管，在接头处就要有不锈钢衬管φ2×20mm、和一些密封用的塑料等材料。从钢瓶到仪器的塑料管的长度视需要而定，不宜过长，然后用塑料管把气源和仪器气体进口、连接起来。
3、外气路的检漏
把主机气路面板上载气，氢气，空气的阀旋钮关闭，然后开启各路钢瓶的高压阀，调节减压阀上低压表输出压力，使载气，空气压力为0.35~0.6Mpa约3.5~6.0kg/cm3、,氢气压力为0.2~0.35Mpa。然后关闭高压阀，此时减压阀上低压表指示值不应下降，如下降，则说明连接气路中有漏，应予排除。
气相色谱仪的进样系统，是进行实行分析的必备环节，只有具备了良好的进样系统，才能保证样品的精确性和分析结果的重现性。
如何对气相色谱仪进样系统的维护
1、汽化室进样口的维护。
由于仪器的长期使用，硅橡胶微粒可能会积聚，造成进样口管道阻塞或气源净化不够，使进样口沾污，此时应对进样口进行清洗。
清洗方法是：
首先从进样口处拆下色谱柱，旋下散热片，清除导管和接头部件内的硅橡胶微粒（注意，接头部分千万不能碰弯），接着用丙酮和蒸馏水依次清洗导管和接头部件，并吹干。
然后按拆卸的相反顺序安装好，最后进行气密性检查。
2、微量注射器的维护。
微量注射器使用前要先用丙酮等溶剂清洗，使用后立即进行清洗处理，以免芯子被样品中高沸点物质沾污而阻塞；
切忌用重碱性溶液洗涤，以免玻璃受腐蚀失重和不锈钢零件受腐蚀而漏水漏气。
对于注射器针尖位固定样式的，不宜吸取有较粗悬浮物质的溶液；一旦针尖阻塞，可用相应0.1mm通针串通，然后用相对应的清洗溶液进行超声清洗。
3、自动进样器的维护。
定期检查自动进样器各个传动杆是否足够润滑，如发现问题，可用酒精棉球进行擦拭，然后涂抹少量液体润滑油，保证传动杆的正常。
定期对自动进样器取样夹手进行检查，如发现损坏请及时更换，否则会造成样品放置位置不正，导致针、针座损坏等。
同时，也要及时用酒精棉签擦拭针座防止灰尘污染阻塞进样针和针座。
高效液相色谱仪作为一种高精密仪器，如果在使用过程中不按照正确操作的话，就容易导致一些问题。其中常见的有柱压问题、漂移问题、峰型异常问题。
一、液相色谱仪压力过低压力过低的现象一般是由于系统泄漏，处理方法：寻找各个接口处，特别是色谱柱两端的接口，把泄漏的地方旋紧即可。当然还有一个原因就是泵里进了空气，但此时表现的往往是压力不稳，忽高忽低，更严重一点会导致泵无法吸上液体。处理方法：打开Purge阀，用3~5ml/min的流速冲洗，如果不行，则要用专用针筒在排空阀处借住外力将气泡吸出。
二、液相色谱仪柱压问题柱压问题是使用高效液相色谱过程中需要密切注意的地方，柱压的稳定与色谱图峰形的好坏、柱效、分离效果及保留时间等密切相关。所谓柱压稳定并不是指压力值稳定于一个恒定值而是指压力波动范围在50PSI之间（在使用梯度洗脱时，柱压平稳缓慢的变化是允许的）。压力过高、过低都属于柱压问题。
三、液相色谱仪压力过高这是高效液相在使用中常见的问题，指的是压力突然升高，一般都是由于流路中有堵塞的原因。此时，我们应该分段进行检查。
（1）.首先断开真空泵的入口处，此时PEEK管里充满液体，使PEEK管低于溶剂瓶，看液体是否自由滴下，如果液体不滴或缓慢滴下，则是溶剂过滤头堵塞。处理方法：用30%的硝酸浸泡半个小时，在用超纯水冲洗干净。如果液体自由滴下，溶剂过滤头正常，在检查；
（2）.打开Purge阀，使流动相不经过柱子，如果压力没有明显下降，则是过滤白头堵塞。处理方法：将过滤白头取出，用10%的异丙醇超声半个小时。如果压力降至100PSI以下，过滤白头正常，在检查；
（3）.把色谱柱出口端取下，如果压力不下降，则是柱子堵塞。处理方法：如果是缓冲盐堵塞，则用95%的水冲至压力正常。如果是一些强保留的物质导致堵塞，则要用比现在流动相更强的流动相冲至压力正常。假如按上面的方法长时间冲洗压力都不下降，则可考虑将柱子的进出口反过来接在仪器上，用流动相冲洗柱子。这时，如果柱压仍不下降，只有换柱子入口筛板，但一旦操作不甚，很容易造成柱效下降，所以尽量少用。
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